Identificação e caracterização de isolados de Paenibacillus spp provenientes de amostras de água e de solo

Abstract

O gênero Paenibacillus, anteriormente pertencente ao gênero Bacillus, tem como representantes bastonetes produtores de esporos que se diferenciam destes pelos padrões encontrados através da amplificação e seqüenciamento de um fragmento da subunidade 16S rDNA. Esse gênero é extremamente diverso sendo encontrado tanto em ambientes aquáticos como em ambientes terrestres, e seus representantes podendo ser desde patógenos de animais a fixadores de nitrogênio (associados ou não a plantas). Dos oitenta bastonetes Gram positivos esporulados isolados dos balneários de Ipanema, Belém Novo e Lami (Porto Alegre/RS), trinta e cinco foram identificados através de PCR como sendo do gênero Paenibacillus e dos sessenta isolados de solo provenientes de Belém Novo (Porto Alegre/RS) e Osório (RS), vinte e nove são pertencentes a este gênero. Nos isolados provenientes da água foram encontrados representantes de P. validus (8), P. azotofixans (6), P. illinoisensis (3), P. chibensis (3), P. glucanolyticus (3), P. borealis (2), P. koreensís (2), P. brasiliensis (2), P. odorífer (1), P. apiarius (1), P. graminís (1), P. macerans (1), P. pabuli (1) e P. thiaminolyticus (1). Entre os indivíduos provenientes de amostras de solo foram identificados P. alginolyticus (7), P. pabuli (5), P. azotofixans (3), P. validus (4), P. thiaminolyticus (2), P. chibensis (2), P. apiarius (2), P. glucanolyticus (2), P. macquariensis (1) e P. peoriae (1). A caracterização genética através de BOX-PCR produziu fragmentos de 4365 a 445bp e revelou vinte e oito grupamentos em um nível de similaridade de 73% nos isolados provenientes da água, e dezoito grupamentos a 70% nos isolados do solo. Pelas análises foi possível identificar um elevado grau de polimorfismo, com diferenças inter e intraespecíficas entre os isolados de Paenibacillus, isso sendo evidenciado pelo alto número de grupamentos encontrados. Os isolados de Paenibacillus provenientes da água e do solo puderam ser separados em grupamentos distintos através do BOX-PCR, sugerindo que populações distintas estejam estabelecendo-se nestes ambientes.

Paenibacillus genus, formerly Bacillus genus, are spore producer rod-shape that differ from Bacillus for the patterns found through 16S rDNA subunit amplification and sequencing. This genus is extremely diverse, being found both on aquatic and land environment, and it can be from animal pathogens to nitrogen fixer (associated or not to piants). From the eighty sporulated Gram positive rod-shape isolated from Ipanema, Belém Novo and Lami (Porto Alegre/RS), tirthy-five were identified through PCR as being Paenibacillus genus and, from the sixty isolated soul samples collected in Belém Novo (Porto Alegre/RS) and Osório (RS), twenty-nine belonged to this genus. Isolates of P. validus (8), P. azotofixans (6), P. iffinoisensis (3), P. chibensis (3), P. glucanolyticus (3), P. borealis (2), P. koreensis (2), P. brasiliensis (2), P. odorifer (1), P. apiarius (1), P. graminis (1), P. macerans (1), P. pabuli (1) and P. thiaminolyticus (1) were found on the isolated coming from water. Among the isolates coming from soil samples, it was identified P. alginolyticus (7), P. pabuli (5), P. azotofixans (3), P. validus (4), P. thiaminolyticus (2), P. chibensis (2), P. apiarius (2), P. glucanolyticus (2), P. macquariensis (1) and P. peoriae (1). The genetic characterization through BOX-PCR produced fragments from 4365 to 445bp and revealed twenty-eight groups with 73% similarity levei on water isolates, and eighteen groups with 70% levei on soil isolates. Through the ran out analysis a high degree of polymorphism were identified, with inter and intraspecific differences between the Paenibacillus isolates, what was observed with the high amount of groups found. The Paenibacillus isolates from water and soil could be separated in distinct groups through BOX-PCR, what suggests that different populations are being established in this environments.