Demography, evolution, health and cultural genocide of South Native Americans : new insights

Abstract

The present thesis intertwines two central themes focused on Native American populations: (1) the dynamics of oral microbiota, emphasizing its implications for the health and evolutionary history of the organisms involved, and (2) the genetic and demographic landscape of Native American populations visualized through the analysis of mitochondrial genomes (mitogenomes), highlighting the importance of genetic studies for these often overlooked communities. As a result, the findings are presented in Chapter 3, where we delve, through a scoping review, into the coevolution of oral microorganisms within the human host, discussing intricate phenomena such as the arms race and the dynamics of the Red Queen or Black Queen. In this chapter, we also explore the impact of dysbiosis on the oral and systemic health of the host, as well as how neglected peoples like Native Americans are doubly affected due to the lack of data on their oral microbiota, oral health, and easy access to treatments. Furthermore, we address the issue of antibiotic resistance and the genes associated with this phenomenon, considering oral microbiota bacteria and the significant warnings from the World Health Organization about the need to advance knowledge and studies in this area. Expanding beyond the oral ecosystem, Chapter 4 explores the demographic dynamics of indigenous populations in the southern part of the Americas. Through analyzing mitogenomes, we posit that contemporary mixed populations play a fundamental role in preserving autochthonous mitochondrial lineages, especially in the southern region. Our comprehensive database of mitogenomes sheds light on genetic diversity and demographic patterns across the continent, revealing distinct patterns among mixed and native populations in the southern cone of South America and those in the Andes and Amazon regions. This underscores the importance of examining diverse geographical and cultural contexts.

A presente Tese entrelaça dois temas centrais tendo como foco central populações indígenas americanas: (1) a dinâmica da microbiota oral, destacando suas implicações para a saúde e a história evolutiva dos organismos envolvidos; e (2) o panorama genético e demográfico das populações indígenas americanas visualizado através da análise de genomas mitocondriais (mitogenomas), salientando a importância dos estudos genéticos para essas comunidades frequentemente negligenciadas. Desse modo, os resultados estão apresentados no Capítulo 3, onde adentramos, através de uma revisão de escopo, tópicos como a coevolução dos microrganismos orais dentro do hospedeiro humano, discutindo fenômenos intrincados como a corrida armamentista e as dinâmicas de Rainha Vermelha ou Rainha Negra. Neste capítulo também é explorado o impacto da disbiose na saúde oral e sistêmica do hospedeiro, e como povos negligenciados como os indígenas americanos são duplamente impactados; diante da falta de dados sobre a sua microbiota e saúde oral, bem como de acesso facilitado aos tratamentos. Ainda, abordamos a preocupante questão da resistência aos antibióticos e os genes associados ao fenômeno, considerando as bactérias da microbiota oral, e os importantes alertas da Organização Mundial de Saúde sobre a necessidade de avançar os conhecimentos e estudos na área. Expandindo para além do ecossistema oral, o Capítulo 4 explora as dinâmicas demográficas das populações indígenas no sul do continente americano. Através da análise dos mitogenomas, postulamos que as populações miscigenadas contemporâneas desempenham um papel fundamental na preservação de linhagens mitocondriais autóctones, especialmente na região sul. Nosso abrangente banco de dados de mitogenomas lança luz sobre a diversidade genética e os padrões demográficos em todo o continente, revelando distintos padrões, considerando as populações miscigenadas e nativas do cone sul da América do Sul e aquelas nas regiões dos Andes e Amazônia. Isso sublinha a importância de examinarmos contextos geográficos e culturais diversos. Além disso, propomos que uma forma de genocídio cultural se fez presente em algumas partes do continente, onde cruzamentos/casamentos assimétricos ocorreu, de modo que a extinção física de muitos indígenas não foi absoluta devido à integração de mulheres nas sociedades nacionais emergentes. Paralelamente a essa incorporação, um extermínio cultural total ocorreu por meio de vários mecanismos explorados em profundidade nesta Tese. Em resumo, nossas descobertas ressaltam a relevância de estudos com populações indígenas, fornecendo uma revisão com dados valiosos sobre a complexa interação entre a microbiota oral e o hospedeiro humano, a negligência no trato com populações autóctones e a diversidade genômica, estabelecendo por fim conexões do binômio saúde/doença com reflexões antropológicas oportunas.