Navegação Química por Assunto "Dinâmica molecular"
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Absorção induzida no infravermelho longínquo na fase líquida do metano
(2008) [Tese]As funções de correlação temporal para o momento de dipolo induzido do metano CH4 líquido, foram simuladas pelo método de dinâmica molecular em quatro estados termodinâmicos, a densidades de 28,10; 27,29; 26,41 e 25,34 ... -
Análise computacional da interação entre novas bases de tröger fluorescentes e o oligonucleotídeo(B-DNA) via docking e dinâmica molecular.
(2012) [Dissertação]Nesse trabalho, o docking e a dinâmica molecular foram utilizados como métodos de investigação das formas de interação entre um oligonucleotídeo de B-DNA e duas novas Bases de Tröger fluorescentes, com o propósito de ... -
Avaliação da manutenção da estrutura secundária da melitina e candida antarctica lipase B em sistemas contendo líquidos iônicos através de dinâmica molecular
(2024) [Tese]Tem sido crescente o uso de líquidos iônicos (LIs) em aplicações envolvendo biomoléculas como DNA, enzimas, proteínas, fosfolipídios e carboidratos. Entre os motivos para tanto, pode-se citar: solubilidade e estabilidade ... -
Dinâmica molecular de jaburetox e peptídeos derivados em bicamada fosfolipídica
(2016) [Tese]O Jaburetox (Jbtx) é um peptídeo entomotóxico liberado a partir da Urease da Canavalia ensiformis no sistema digestivo de insetos suscetíveis. Foi demonstrada experimentalmente a ação do Jaburetox no rompimento de bicamadas ... -
Dinâmica molecular dirigida aplicada ao estudo de desenovelamento de um aptâmero de RNA
(2019) [Tese]Neste trabalho foi aplicada a técnica de simulação por dinâmica molecular dirigida com solvente implícito, de forma a estudar o processo de desnaturação de um aptâmero de RNA de fita dupla e de dois complexos com as moléculas ... -
Dinâmica molecular do fármaco antitumoral ecteinascidina e sua interação com o DNA
(2008) [Dissertação]Neste trabalho usamos simulações de Dinâmica Molecular para analisarmos interações e alterações estruturais em complexos não covalentes e covalentes entre o fármaco Ecteinascidina (ET743) e o DNA (modelado como dodecâmeros). ... -
Estudo computacional da interação entre bicamada lipídica aniônica e moricina
(2006) [Dissertação]Neste trabalho foram desenvolvidas cinco simulações: Moricina no vácuo; moricina em meio fisiológico (água e íons); membrana em meio fisiológico; 1 moricina e 6 moricinas no interior da membrana. O objetivo é avaliar as ... -
Estudo computacional das monoaminoxidases A e B com substratos e inibidores
(2014) [Dissertação]A monoaminoxidase (MAO) é uma enzima importante, que pode atuar como alvo terapêutico. Inibidores da MAO-A apresentam atividade no tratamento de distúrbios de humor, enquanto os inibidores seletivos da MAO-B tem uso, ... -
Estudo computacional de líquidos iônicos do tipo imidazólio com substituintes insaturados
(2012) [Tese]Os métodos computacionais da química quântica foram empregados para estudar as estruturas moleculares e as energias de interação de cátions e ânions que são componentes de alguns líquidos iônicos funcionalizados, derivados ... -
Estudo da interação de líquidos iônicos de interesse farmacológico com membrana POPC por simulação de dinâmica molecular
(2015) [Dissertação]Alguns Agentes Farmacêuticos (AF) sólidos podem ser otimizados através de ajustes nas propriedades físicas, permitindo maior controle na solubilidade, estabilidade, biodisponibilidade e farmacocinética. Líquidos iônicos, ... -
Estudo da solubilização da queratina da lã de ovelha em líquidos iônicos por dinâmica molecular
(2023) [Dissertação]Uma grande parcela do que conhecemos como indústria têxtil é baseada no uso da lã da ovelha (Ovis aries). No processo de tratamento dessa lã temos uma grande quantidade de resíduo não utilizado por este tipo de indústria. ... -
Estudo teórico da solvatação de ânions em solventes orgânicos
(2005) [Dissertação]O presente trabalho relata a parametrização do modelo de contínuo IEF-PCM para o estudo da solvatação de ânions monovalentes em acetonitrila e N,N-dimetilformamida. Nós propomos duas metodologias de parametrização do modelo ... -
Influência de parâmetros moleculares em funções de correlação temporal na dinâmica de solvatação mecânica
(2004) [Tese]No presente trabalho descrevemos nossos resultados relativos à investigação da dinâmica de solvatação mecânica por meio de simulações por dinâmica molecular, respeitando o regime da resposta linear, em sistemas-modelo de ... -
Investigação computacional das doenças priônicas : influência dos campos de força e dos estados de protonação na conversão estrutural da proteína príon celular
(2018) [Tese]Príons são proteínas que causam um grupo de doenças neurodegenerativas invariavelmente fatais, sendo uma das mais conhecidas a encefalopatia espongiforme bovina (ou doença da vaca louca). A proteína príon celular (PrPc), ... -
Investigação computacional das propriedades estruturais, termodinâmicas e dinâmicas do polímero termossensível poli(N-isopropilacrilamida) em solução aquosa
(2016) [Tese]Polímeros termossensíveis apresentam grandes alterações em suas propriedades quando submetidos a pequenas mudanças de temperatura (T) próximas à temperatura de solução crítica inferior (LCST) ou superior (UCST). Um dos ... -
Investigação computacional da vitrificação da água de solvatação do DNA
(2012) [Dissertação]Motivado por evidencias experimentais, foram realizadas extensivas simulações clássicas de dinâmica molecular de soluções aquosas de DNA visando investigar a transição vítrea. Estudou-se o dodecâmero de Dickerson solvatado ... -
Investigação computacional dos mecanismos de interação entre bases de tröger e o DNA
(2010) [Dissertação]Neste trabalho, a docagem e a dinâmica molecular foram utilizadas para investigar a interação entre oligonucleotídeos e duas bases de Tröger: uma base simétrica - contendo duas proflavinas – e uma base assimétrica – contendo ... -
Investigação da interação de ligantes fluorescentes derivados de benzazóis com B-DNA por docking e dinâmica molecular
(2013) [Tese]Neste trabalho foi realizado o estudo por docagem e simulação de dinâmica molecular de doze derivados benzazólicos fluorescentes por ESIPT, interagindo com o dodecâmero de Dickerson-Drew na forma B-DNA. Estes doze ligantes ... -
Investigação mecanística de ciclios orgânicos para fixação de CO2 na presença de líquidos iônicos : uma abordagem teórico-computacional
(2015) [Tese]A constante emissão de CO2 na atmosfera devido a fontes antropogênica despertou uma preocupação crescente em função da sua atuação no efeito estufa. Um número crescente de metodologias para redução da concentração deste ... -
Modelagem molecular no estudo das interações receptor-ligante e no desenho racional de inibidores da biossíntese de petrobactina em Bacillus Anthracis deidroshikimato desidratase como alvo de novas terapias anti-antraz
(2017) [Dissertação]O antraz é uma doença infecciosa aguda grave, com uma taxa de mortalidade superior a 90% em sua forma respiratória, causada pelo Bacillus anthracis, uma bactéria altamente virulenta, que está desenvolvendo resistência e ...