Monitoramento do vírus influenza em aves migratórias e residentes no litoral do Rio Grande do Sul, Brasil

Abstract

A influenza aviária (IA) é uma doença viral infecciosa que, desde a pandemia de 1918, representa risco global à saúde pública. O vírus da influenza aviária (VIA) gera novas variantes devido à alta taxa de mutação e ao rearranjo genético entre cepas, além de seu potencial zoonótico, o que torna essencial o monitoramento contínuo para minimizar os impactos dos subtipos emergentes. Muitas aves migratórias atuam como reservatórios, disseminando subtipos — alguns de alta patogenicidade — que ameaçam a avifauna local e podem ser transmitidos a humanos. Este estudo investigou a circulação do VIA entre aves migratórias e residentes no litoral norte e médio do Rio Grande do Sul, Brasil. A área foi escolhida por sua importância ecológica, integrando um corredor migratório na América do Sul, com zonas entremarés ricas em recursos alimentares, locais estratégicos para descanso e forrageio de aves costeiras e limícolas. Foram coletadas 760 amostras de excreta cloacal fresca, imediatamente após a defecação dos bandos, em áreas intermareais. Esse tipo de amostra é amplamente utilizado em vigilância viral por ser menos invasivo e refletir a circulação viral recente. Apesar da presença de uratos e outros inibidores naturais ambientais que podem comprometer a eficiência da RT-PCR, os procedimentos de coleta, armazenamento e o uso de controles internos asseguraram a confiabilidade dos resultados. detecção do genoma viral foi realizada por RT-PCR em tempo real, método padronizado pela Organização Mundial da Saúde (OMS). A taxa de positividade foi de 1,71% (13/760), compatível com cenário não epidêmico. As amostras positivas foram de aves da família Laridae, reconhecidas como reservatórios naturais do VIA. Apenas uma amostra apresentou carga viral suficiente para subtipagem, identificada como vírus da influenza aviária de baixa patogenicidade (LPAIV) H13N6. A sequência parcial do gene hemaglutinina (HA) identificada neste estudo representa a primeira detecção genética do subtipo H13 do vírus da influenza aviária na região. A ocorrência de amostras positivas em três períodos distintos de coleta sugere padrões sazonais e comportamentais associados à migração e reprodução, reforçando a importância do monitoramento contínuo dos vírus da influenza aviária nessa área ecologicamente relevante.

Avian influenza (AI) is an infectious viral disease that, since the 1918 pandemic, poses a global public health risk. The avian influenza virus (AIV) generates new variants due to its high mutation rate and genetic reassortment among strains, in addition to its zoonotic potential, making continuous monitoring essential to minimize the impacts of emerging subtypes. Many migratory birds act as reservoirs, disseminating subtypes— some highly pathogenic—that threaten local bird populations and can be transmitted to humans. This study investigated AIV circulation among migratory and resident birds along the northern and mid-littoral regions of Rio Grande do Sul, Brazil. The area was selected for its ecological importance, integrating a migratory corridor in South America with intertidal zones rich in food resources, serving as strategic resting and foraging sites for coastal and shorebirds. A total of 760 fresh cloacal fecal samples were collected immediately after defecation from flocks in intertidal areas. This sampling method is widely used in viral surveillance for being less invasive and reflective of recent viral circulation. Despite the presence of urates and other natural environmental inhibitors that can compromise RT-PCR efficiency, collection and storage procedures alongside internal controls ensured reliable results. Viral genome detection was performed using real-time RT-PCR, a method standardized by the World Health Organization (WHO). The positivity rate was 1.71% (13 out of 760 samples), consistent with a non-epidemic scenario. Positive samples were from birds of the Laridae family, known natural reservoirs of AIV. Only one sample had sufficient viral load for subtype identification, revealing a low pathogenic avian influenza virus (LPAIV) H13N6. The partial sequence of the hemagglutinin (HA) gene identified in this study represents the first genetic detection of the H13 subtype of avian influenza virus in the region. The occurrence of positive samples in three distinct collection periods suggests seasonal and behavioral patterns associated with migration and reproduction, reinforcing the importance of continuous monitoring of avian influenza viruses in this ecologically significant area.