Caracterização molecular de vacinas comerciais e isolados brasileiros de Salmonella Gallinarum

Abstract

Salmonella enterica subespécie enterica do sorotipo Gallinarum pode causar doença sistêmica grave em galinhas e uma vacina viva de Salmonella Gallinarum 9R (SG9R) tem sido amplamente utilizada para controlar a doença. O objetivo do presente estudo foi determinar se a cepa 9R da vacina viva de Salmonella Gallinarum foi responsável por causar surtos de Tifo Aviário em lotes de galinhas de reprodutores de galinhas e perus, além de verificar a resistência antimicrobiana dos isolados dos surtos. A reação em cadeia da polimerase triplex, o teste antimicrobiano padrão, a identificação de genes de beta-lactamase e o sequenciamento completo do genoma pelo Ion Torrent PMG foram utilizados nos isolados de campo e na cepa vacinal de S. Gallinarum. Os 60 isolados testados não eram de origem vacinal e apresentaram alta resistência a medicamentos dos grupos de macrolídeos e quinolonas. O sequenciamento completo do genoma (WGS) e a análise de polimorfismo de nucleotídeo único em isolados selecionados para genes essenciais de Salmonella enterica confirmaram a origem selvagem desses isolados e mostraram duas possíveis fontes de S. Gallinarum nos surtos estudados. S. Gallinarum isoladas de surtos de Tifo Aviário no período estudado não foram causadas pelo uso da vacina viva SG9R. A fonte das cepas sequenciadas foi diversificada.

Salmonella enterica subspecies enterica serotype Gallinarum can cause severe systemic disease in chickens and a live Salmonella Gallinarum 9R vaccine (SG9R) has been used widely to control disease. The aim of the present study was to determine if the 9R-strain of the Salmonella Gallinarum live vaccine was responsible for having fowl typhoid outbreaks in chicken flocks from both chicken and turkey breeders as well as to verify the antimicrobial resistance of the isolates from the outbreaks. The triplex polymerase chain reaction, standard antimicrobial test, beta-lactamase genes identification and Ion Torrent PMG whole-genome sequence were used in the field isolates and in the vaccine strain of S. Gallinarum. The 60 tested isolates were not from vaccine origin and manifested high resistance to drugs from macrolide and quinolone groups. Whole-genome sequencing (WGS) and single nucleotide polymorphism analysis on selected isolates for core genes from Salmonella enterica confirmed the wild origin of these isolates and showed two possible sources of S. Gallinarum in the studied outbreaks. S. Gallinarum isolated from fowl typhoid outbreaks in the studied period were not caused using the SG9R live vaccine. The source of strains sequenced was diverse.