Ameaçada, rara e diversa : avaliação genômica revela linhagem críptica em espécie dos campos sulinos

Abstract

A Serra do Sudeste é considerada um centro de diversidade do gênero Petunia, com a distribuição de duas espécies endêmicas e outras duas de ampla distribuição. Petunia secreta é uma espécie com distribuição restrita apenas à localidade denominada Pedra do Segredo. A espécie é classificada como rara, endêmica e em perigo de extinção. Em 2014, uma população numerosa, composta por indivíduos com morfologia similar à P. secreta, foi encontrada em um ambiente antropizado, na beira da rodovia BR-290. A caracterização genética desta população mostrou acentuada diferenciação em relação às populações da área original de descrição da espécie. Aqui realizamos uma investigação sobre a origem dessa população por meio de variações encontradas em nível genômico, comparando-a com populações naturais de outras espécies do gênero de ocorrência próxima à população de interesse. Os resultados sugerem inexistência de fluxo gênico com as espécies P. integrifolia e P. exserta; presença de um componente genético exclusivo à BR-290; compartilhamento parcial de polimorfismos com P. axillaris e P. secreta canônica. A análise da demografia histórica demonstrou que a linhagem BR-290 teria surgido a partir de um ancestral comum com P. secreta, com tempo de divergência estimado em 25 Kya, coincidindo com as mudanças climáticas do Pleistoceno. Desta forma, sugere-se que esta linhagem seja considerada uma forma independente e críptica a P. secreta, devendo ser tida como uma nova espécie no gênero e protegida como tal.

Serra do Sudeste is considered a center of diversity of the genus Petunia, with the distribution of two endemic and two widely distributed species. Petunia secreta is narrowly distributed, restricted to the locality called Pedra do Segredo. The species is classified as rare, endemic, and endangered. In 2014, a large population, composed of individuals with a morphology similar to P. secreta, was found in an anthropized environment, on the side of the BR-290 highway. The genetic characterization of this population showed marked differentiation in relation to the populations of the original area of P. secreta description. Here, we carry out an investigation into the origin of this population based on variations at the genomic level, comparing natural populations of other Petunia species occurring close to the BR-290 population. The results suggested that there is no gene flow with P. integrifolia and P. exserta; BR-290 shows an exclusive genetic component; there is partial polymorphism sharing between BR-290 and P. axillaris and canonical P. secreta. The analysis of historical demography showed that the BR-290 lineage would have emerged from a common ancestor with P. secreta, with an estimated divergence time of 25 Kya, coinciding with the Pleistocene climate changes. Thus, it is suggested that this lineage should be considered as an independent and cryptic form of P. secreta, and should be considered as a new species in the genus and protected as such.