Otimização de cavidades moleculares usando o modelo do contínuo polarizável (PCM) nos métodos semiempíricos AM1 e MNDO/PM3

Abstract

Um aperfeiçoamento da definição de cavidades moleculares utilizando ralOS atômicos dependentes de cargas atômicas líquidas é proposto para cálculo do efeito de solvente no Modelo do Contínuo Polarizável (PCM). Este procedimento acoplado aos métodos semiempíricos AM1 e MNDO/PM3 aproximou significativamente os resultados calculados e experimentais. Um conjunto de moléculas neutras contendo diferentes grupo funcionais foi usado para parametrizar funções que relacionam os raios atômicos às cargas Mulliken. Outro conjunto de moléculas neutras foi utilizado para testar estas funções e foram observados erros RMS de 0,47 kcal.mol-¹ para AM1, e 0,74 kcal.mol-¹ , para MNDO/PM3.

An improvement of Polarizable Continuum Method (PCM) results coupled to the AM1 and MNDO/PM3 semiempirical methods has been obtained by an optimization of the molecular cavities using charge dependent atomic radii. A set of neutral molecules, containing different functional groups, has been used to parameterize functions relating Mulliken atomic net charges to atomic radii. Another set of neutral molecules has been utilized to test these functions. The RMS errors in free energy of solvation were 0.47 kcal.mol-¹ for AM1 and 0.74 kcal.mol-¹ for MNDO/PM3.