Amplification of 16S rRNA gene sequences to differentiate two highly related bradyrhizobia species

Abstract

Foi avaliado um método baseado em PCR do gene do RNAr 16S, desenvolvido com a finalidade de um diagnóstico molecular rápido na identificação das espécies filogeneticamente relacionadas Bradyrhizobium japonicum e B. elkanii, isoladas de nódulos de soja, visando ao seu emprego na identificação de estirpes mais competitivas e com maior capacidade de fixação de nitrogênio para uso na formulação de inoculantes comerciais. O método usado foi capaz de discriminar dez estirpes-padrão pertencentes a essas duas espécies de Bradyrhizobium, assim como identificar eficientemente 37 estirpes isoladas de lavouras cultivadas com soja.

A 16S rRNA gene PCR-based assay was developed aiming at a fast molecular diagnostic method to differentiate the two phylogenetically closely related species Bradyrhizobium japonicum and B. elkanii, isolated from soybean nodules, in order to identify those more competitive and comprising greater nitrogen fixation ability for use in the formulation of commercial inoculants. The assay used was able to discriminate ten reference strains belonging to these two Bradyrhizobium species, as well as to efficiently identify 37 strains isolated from fields cultivated with soybean.