Inferência de raiz evolutiva de genes como base para a simulação de crescimento de genomas

Abstract

O genoma pode ser de nido como toda a informação hereditária de um organismo e esta informação está codi cada no DNA. Conhecendo a sequência de nucleotídeos de uma molécula de DNA poderemos identi car os genes que ela contém e assim estudá-los. Com os avanços da genética ao longo das últimas décadas foi possível decodi car e mapear o genoma de várias espécies e com isso comparar suas sequências de genes o que permite pesquisar como tais espécies estão relacionadas, isto é, quais os caminhos evolutivos que levaram à diversidade de organismos observadas atualmente. Compreender a evolu- ção do genoma é fundamental para compreender a evolução dos organismos. Como base para o estudo de evolução de genomas utilizamos a abordagem de ganho/penalidade, Mirkin et al. [1], para a inferência dos genes ancestrais comuns a grupos de genes ortólogos presentes nos organismos atuais.

Genome can be de ned as any hereditary information of an organism and this information is encoded in DNA. Knowing the nucleotide sequence of a DNA molecule, we can identify their genes and study them. With advances in genetics over the past decades it has been possible to decode and map the genome of various species and compare them what allow us to investigate how these species are related and nd what evolutionary paths that led to the diversity of organisms observed today. Understanding the evolution of the genome is fundamental to understanding the evolution of organisms. As a basis for studying the evolution of genomes we used the approach of gain/penalty, Mirkin et al. [1], for the inference of ancestral genes common to orthologous groups of genes present in modern organisms.