The influence of HIV-1 subtypes C, CRF31_BC and B on disease progression and initial virologic response to haart in a southern Brazilian cohort

Abstract

Although most HIV-1 infections in Brazil are due to subtype B, Southern Brazil has a high prevalence of subtype C and recombinant forms, such as CRF31_BC. This study assessed the impact of viral diversity on clinical progression in a cohort of newly diagnosed HIV-positive patients. Methods: From July/2004 to December/2005, 135 HIV-infected patients were recruited. The partial pol region was subtyped by phylogeny. A generalized estimating equation (GEE) model was used to examine the relationship between viral subtype, CD4+ T cell count and viral load levels before antiretroviral therapy. Hazard ratio (Cox regression) was used to evaluate factors associated with viral suppression (viral load < 50 copies/mL at six months). Results: Main HIV-1 subtypes included B (29.4%), C (28.2%), and CRF31_BC (23.5%). Subtypes B and C showed a similar trend in CD4+ T cell decline. Comparison of non-B (C and CRF31_BC) and B subtypes revealed no significant difference in the proportion of patients with viral suppression at six months (week 24). Higher CD4+ T cell count and lower viral load were independently associated with viral suppression. Conclusion: No significant differences were found between subtypes; however, lower viral load and higher CD4+ T cell count before therapy were associated with better response.

Introdução: Embora a maioria das infecções de HIV-1 no Brasil seja devido ao subtipo B, o Sul do Brasil apresenta uma alta prevalência do subtipo C e formas recombinantes, como CRF31_BC. Este estudo avaliou o impacto da diversidade viral na evolução clínica em uma coorte de pacientes HIV-positivos recém diagnosticados. Métodos: De julho/2004 a dezembro/2005, 135 pacientes anti-HIV reagentes foram recrutados. A região pol parcial foi subtipada por filogenia. Um modelo de equação de estimativa generalizada (GEE) foi utilizado para examinar a relação entre subtipo viral, contagem de células CD4 e níveis de carga viral pré-terapia antirretroviral. Hazard ratio (regressão de Cox) foi utilizada para avaliar os fatores associados à supressão viral (carga viral < 50 cópias/mL em seis meses). Resultados: Os principais subtipos de HIV-1 incluíram B (29,4%), C (28,2%) e CRF31_BC (23,5%). Os subtipos B e C apresentaram uma tendência semelhante no declínio de células CD4. Quando comparados os subtipos não B (C e CRF31_BC) e B, não houve diferença significativa na proporção de pacientes com supressão viral aos seis meses (24 semanas). CD4 mais alto e carga viral mais baixa demonstraram associação independente com supressão viral. Conclusão: Não houve diferença significativa entre os subtipos; entretanto, viremia mais baixa e CD4 mais alto pré-terapia mostraram associação com melhor resposta.