Um estudo computacional da interação entre esqualamina e membranas bacterianas

Abstract

O estudo das interações entre fármaco e membrana é de grande importância na elaboração de medicamentos e na explicação do mecanismo de ação destes. A atividade de um fármaco resulta do contato com membranas celulares, portanto, é importante saber quais grupos do fármaco interagem mais fortemente com determinados grupos dos fosfolipídeos ou lipídeos que estão presentes na membrana. Neste trabalho buscou-se compreender quais as interações que ocorrem entre a Esqualamina (um aminoesteroide com potencialidade farmacológica) e membranas bacterianas Gram-positivas e Gram-negativas. Foi usada como modelo para as bactérias Gram-positivas uma membrana na forma de bicamada fosfolipídica composta somente pelo fosfolipídeo POPG. Para as bactérias Gram-negativas foi utilizada uma bicamada composta por fosfolipídeos do tipo POPG e POPE, além de lipídeos A na parte exterior. Utilizando-se o método de Dinâmica Molecular obteve-se 4 sistemas distintos com tempo final de simulação entre 90 nanosegundos e 200 nanosegundos. Os sistemas diferem quanto ao número de Esqualaminas e/ou composição da membrana. Para verificar os sistemas foram feitas análises de Perfil de Densidade, Função de Distribuição Radial, espessura da membrana e área por fosfolipídeo. Foi observado que as moléculas de Esqualamina interagem com os grupos propostos para as diferentes membranas, além de o número de Esqualaminas no sistema alterar as interações que ocorrem. Para os três sistemas que possuíam o aminoesteroide verificou-se que o tempo de simulação é muito curto para que possam ser extraídos resultados definitivos.