Análise global do metabolismo de cofatores [Fe-S] em Azotobacter vinelandii

Abstract

Cofatores ferroenxofre [FeS] são espécies químicas amplamente distribuídas na natureza, cuja versatilidade habilitaos a participar de inúmeros processos biológicos. Dada a toxicidade de Fe e S livres, os organismos vivos utilizam maquinarias especializadas na biossíntese e no transporte de cofatores [FeS]. Há grande interesse na identificação de novas proteínas capazes de atuar em estágios intermediários do metabolismo [FeS]; assim, este trabalho investiga o genoma da bactéria Azotobacter vinelandii, organismo modelo nesse campo de pesquisa, buscando novos membros dedicados à biologia geral de grupamentos [FeS]. O estudo baseiase em algoritmos de predição de motivos conservados de aminoácidos e na determinação de sítios de ligação ao elemento regulatório [FeS] IscR, com o auxílio de matrizes de probabilidade. A aplicação dos recursos acima descritos gerou uma lista completa de proteínas [FeS] de A. vinelandii com unidades de transcrição estimadas e análises de função, homologia e interações proteínaproteína. Além disso, a montante de dez genes identificouse motivos de ligação a IscR estatisticamente significativos. Esses elementos foram extensivamente investigados, sete deles codificando polipeptídeos nãocaracterizados ou hipotéticos. De modo geral, os resultados obtidos agregam conhecimento ao estudo de cofatores [FeS] e propiciam uma nova ferramenta de referência para futuras investigações práticas.