Diversidade genética de actinobactérias utilizando BOX-PCR e REP-PCR

Abstract

Os microrganismos apresentam um importante papel na produção de compostos de interesse para a indústria farmacêutica. Estudos em biologia molecular apontam o potencial de produção de metabólitos secundários por bactérias do gênero Streptomyces. São microrganismos Gram positivos distribuídos em diferentes ecossistemas terrestres e aquáticos e de difícil identificação, em vista disso, as técnicas mais modernas de identificação baseiam-se no sequenciamento da região 16S do DNA ribossomal, porém, sem uma discriminação exata entre espécies relacionadas. Técnicas de DNA fingerprint vêm sendo aplicadas para resolver questões de identificação dos diferentes microrganismos e a aplicação de primers específicos a certas regiões fornece padrões de amplificação que se mostram eficientes à identificação de uma gama de organismos. As técnicas de fingerprint BOX-PCR e REP-PCR empregam primers com elementos repetitivos, gerando padrões de bandas característicos a cada amostra, utilizado como forma de identificação de cepas bacterianas. O presente trabalho objetivou observar diversidade genética dos isolados de actinobactérias coletados em solo antártico, utilizando a técnica BOX-PCR e REP-PCR. Foram comparados os perfis de amplificação de 49 amostras e 36% destas agruparam-se com similaridade superior a 90% em ambas reações. Também se observou a presença de um fragmento de tamanho comum nos isolados analisados com o primer BOX-A1R.