A visualization-based approach for the taxonomy browser interface

Abstract

The process of collecting biological data is a continuous activity, specially in field work for university projects and courses. Data from these collections needs to be properly stored in order to be readily available for future analysis. This is particularly important since a significant amount of data tends to be lost when the students responsible for collection leave their undergraduate or graduate programs and do not share their contributions for future projects. These students are frequently worried about storing their work on a public database. TaxonomyBrowser is a biodiversity information system developed to manage data collected by biologists during field work, as well as specimens registered in museum collections. This work describes a new approach on the TaxonomyBrowser’s user interface, focusing on providing an easier and more intuitive method of visualizing and managing the database information. The interface layout was based on Shneiderman’s Visual Information Seeking Mantra: overview first, zoom and filter, then details on demand. We limited the access to certain specimen’s information depending on the user’s authentication by altering the original database structure in order to associate each specimen created to accounts or groups of users.

O processo de coletar dados biológicos é uma atividade contínua, especialmente em trabalhos de campo realizados para projetos e disciplinas na universidade. Dados dessas coleções precisam ser guardados apropriadamente para que estejam disponíveis em caso de futuras análises. Isso é particularmente importante já que uma quantidade significativa de dados tende a ser perdido quando os alunos responsáveis pela coleção desligam-se da universidade sem compartilhar suas contribuições para trabalhos futuros. Esses estudantes estão frequentemente apreensivos em registrar o seu trabalho em um banco de dados de acesso público. TaxonomyBrowser é um sistema de informação de biodiversidade desenvolvido para o gerenciamento de dados coletados por biólogos em trabalhos de campo, como também de espécimes cadastrados em museus. Esse trabalho descreve uma nova abordagem à interface do TaxonomyBrowser, focando em prover um método mais fácil de visualizar e gerenciar informação do banco de dados. O layout da interface foi baseado no mantra de visualização de informação de Shneirderman: primeiramente visão geral, zoom e filtragem, e então detalhes por demanda. O acesso da informação de certos espécimes foi limitado dependendo do nível de autenticação do usuário acessando o sistema por meio de alterações na estrutura do banco de dados para associar cada espécime com contas e grupos de usuário.