Sequenciamento de última geração aplicado à virologia veterinária

Abstract

Os vírus são microrganismos que ocorrem em todos os seres vivos e possuem altas taxas de mutação, sendo assim, necessitam de técnicas adequadas para sua detecção. A metagenômica viral permite a investigação da flora viral de animais saudáveis e doentes através de uma série de plataformas, denominadas “Next-Generation Sequencing” (NGS), que estão disponíveis no mercado e utilizam diferentes processos de sequenciamento do genoma. Através dessas metodologias, pode-se melhorar o entendimento da etiologia de doenças, assim como aprofundar o conhecimento sobre a circulação viral na natureza e sua interação com os hospedeiros. O objetivo do presente trabalho é realizar uma revisão bibliográfica sobre as diferentes plataformas de NGS e suas aplicações na virologia, assim como relatar a detecção de novas espécies e cepas virais na medicina veterinária através dessas plataformas.

Viruses are microorganisms that affect all living beings, with high mutation rate, therefore need apropriate detection techniques. Viral metagenomics allows the viral flora research of healthy and sick animals with a variety approaches, called “Next-Generation Sequencing” (NGS), which are available in the market and use different genome sequencing procedures. Through these methods is possible to improve diseases etiology, increasing viral circulation knowledge in the nature and host interaction. The aim of the present study is to perform a bibliographic review about different NGS platforms and their virology applications, as well as report the detection of new viruses or viral strains in veterinary medicine through these platforms.