Avaliação do micobioma intestinal em diferentes fases da doença hepática esteatótica associada à disfunção metabólica

Abstract

Introdução: A disbiose do microbioma intestinal (GM) está associada ao desenvolvimento e progressão da doença hepática esteatótica associada à disfunção metabólica (MASLD) e da esteato-hepatite (MASH). O GM humano contém bactérias, fungos, archaea e vírus. O micobioma intestinal (GMyco), ou seja os fungos, é ainda pouco estudado em indivíduos com MASLD. Objetivos: Investigar o GMyco em diferentes fases da MASLD. Métodos: Foram recrutados 28 indivíduos: controles, n=6; MASH, n=6; cirrose, n=7; e carcinoma hepatocelular (CHC), n=5. As amostras de fezes foram colhidas e armazenadas num congelador a -80°C para extração de DNA e sequenciamento com amplificação da região 18S. As variantes de sequência única obtidas foram comparadas com a base de dados SILVA. Resultados: 77,9% eram mulheres, IMC médio de 31,4 kg/m2 (obesidade grau I), consumo diário de álcool (<30 g em homens ou <20 g em mulheres) em 17,4%, antibióticos nos últimos 6 meses em 30,4%. Os indivíduos com MASH apresentavam uma maior diversidade de GMyco alfa (p<0,05 - MASH vs controle). O grupo controle apresentou uma maior abundância do filo Ascomycota, e os indivíduos com MASH uma maior abundância de Basidiomycota. Em termos de taxonomia familiar, os controles apresentaram maior abundância de Aspergillaceae, enquanto os cirróticos apresentaram maior abundância de Malasseziaceae e Sporidiobolaceae, e os indivíduos com CHC apresentaram maior abundância de Saccharomycetacea. Na análise da abundância relativa entre os grupos, apenas uma variante de sequência única (ASV), gênero Naganishia, estava homogeneamente distribuída nos indivíduos MASH e ausente nos controles. Conclusão: O perfil do GMyco varia nos diferentes estratos da MASLD. Os basidiomicetos, que eram mais elevados na MASH, foram previamente descritos em indivíduos obesos. Os resultados sugerem que os fungos podem ser um potencial marcador biológico no espetro da MASLD.

Introduction: Dysbiosis of the gut microbiome (GM) is associated with the development and progression of metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease (MASLD) and steatohepatitis (MASH). Human GM contains bacteria, fungi, archaea and viruses. Intestinal mycobiome (GMyco), i.e. fungi, is still poorly studied in individuals with MASLD. Objectives: To investigate GMyco in different stages of MASLD. Methods: 28 individuals were recruited: controls, n=6; MASH, n=6; cirrhosis, n=7; and hepatocellular carcinoma (CHC), n=5. Stool samples were collected and stored in a freezer at -80°C for DNA extraction and sequencing with amplification of the 18S region. The single sequence variants obtained were compared with the SILVA database. Results: 77.9% were women, average BMI of 31.4 kg/m2 (grade I obesity), daily alcohol consumption (<30 g in men or <20 g in women) in 17.4%, antibiotics in the last 6 months in 30.4%. Individuals with MASH had a greater diversity of GMyco alpha (p<0.05 - MASH vs control). The control group had a higher abundance of the phylum Ascomycota, and the MASH patients had a higher abundance of Basidiomycota. In terms of family taxonomy, controls had a higher abundance of Aspergillaceae, while cirrhotic patients had a higher abundance of Malasseziaceae and Sporidiobolaceae, and individuals with CHC had a higher abundance of Saccharomycetacea. In the analysis of relative abundance between the groups, only one unique sequence variant (ASV), genus Naganishia, was homogeneously distributed in the MASH individuals and absent in the controls. Conclusion: The GMyco profile varies in the different strata of the MASLD. Basidiomycetes, which were higher in MASH, have previously been described in obese patients. The results suggest that fungi may be a potential biological marker in the MASLD spectrum.