Análise de elementos transponíveis presentes nos genomas de borboletas Heliconius : uma abordagem com ferramentas de bioinformática

Abstract

Borboletas do gênero Heliconius tem sido alvo de pesquisas biológicas, genéticas, ecológicas e desenvolvimento. A análise de Elementos Transponíveis (ET) nesses organismos visa compreender melhor esses genomas e tentar desvendar as suas intrincadas relações evolutivas. Este estudo teve por objetivo caracterizar os ETs presentes nos genomas de Heliconius disponíveis no NCBI e averiguar a presença de ETs já descritos para H. melpomene em outros organismos. Um total de 269 ETs disponíveis na base de dados RepBase foram usados para confrontar com dados disponíveis no NCBI através do BLASTN. Os resultados foram submetidos às análises no programa Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA). Cerca de 10,9% do total de ETs de Classe I e cerca de 29,4% do total de ET de Classe II apresentaram similaridades de 80-100% em relação a sequências de H. numata e H. erato. Em relação as sequências de outros organismos, cerca de 0,57% dos ETs de Classe I e 7,36% dos ETs de Classe II apresentaram similaridades entre 80-100% em relação a sequências provenientes de Hymenoptera, Lepidoptera e Diptera.

Butterflies of the genus Heliconius have been the subject of biological, genetic, ecological and developmental researches. The analysis of Transposable Elements (TEs) in these butterflies search for a better understanding of their genome structure as well as their intricate evolutionary relationships. The study aims to characterize the TEs in Heliconius genomes available in the NCBI and to investigate the presence of TEs already described for H. melpomene in other organisms. A total of 269 TEs available in the RepBase were used in Blastn to compare with data available in NCBI and the results were submitted to MEGA. About 10.3% of the total Class I ETs and about 29,4% of the total Class II ET showed similarities of 80-100% to the sequences of H. numata and H. erato. As for the sequences of other organisms, about 0,57% of Class I TEs and 7,36% of Class II TEs showed similarities between 80 -100% in relation to sequences from Hymenoptera, Lepidoptera and Diptera.