Identificação e caracterização dos fatores de transcrição DOF de pitangueira (Eugenia uniflora L.)

Abstract

A pitangueira (Eugenia uniflora L.) é uma planta frutífera da família Myrtaceae, nativa do Brasil e apresenta ampla distribuição ao longo do território nacional. Suas populações estão adaptadas a condições climáticas contrastantes, como as condições secas e solo arenoso da restinga, bem como a mata fechada e ombrófila da mata ciliar. Já caracterizados no processo de adaptação e desenvolvimento, os fatores de transcrição DOF são proteínas reguladoras da expressão gênica do tipo dedo de zinco específicas de plantas. Essas características os tornam excelentes candidatos para o estudo da adaptação das populações de E. uniflora, visto que provavelmente contribuem para isso. Neste trabalho, foram identificados um total de 17 genes DOF no transcritoma de E. uniflora, com dois deles possuindo o domínio incompleto e sendo retirados de análises subsequentes. A partir da construção das árvores filogenéticas de aminoácidos e nucleotídeos, as sequências DOF se agruparam em 11 grupos funcionais distintos, possibilitando a predição funcional de 10 genes de E. uniflora. O resultado da análise de motivos conservados corroborou com os das análises evolutivas e a análise de pressão seletiva confirmou a ampla seleção purificadora atuante no domínio DOF. Em conclusão, esse estudo possibilitou a identificação de genes DOF em pitangueira ainda não identificados. Enquanto isso, as análises evolutivas traçaram um rumo para estudos funcionais futuros a partir da predição de grupos funcionais conservados, além de elucidar questões ainda não respondidas.

The Brazilian-cherry tree (Eugenia uniflora L.) is part of the Myrtaceae family of plants. It’s a native plant with wide distribution among the Brazilian territory where its different populations are adapted to contrasting climatic conditions such as the salty and dry soil of the restinga, as well as the ombrophilous Atlantic forest. Thoroughly characterized in many development and adaptation processes, DOF transcription factors are plant specific regulatory proteins that have a zinc finger like domain. These characteristics make them well suited candidates for a study on the adaptation of the different Brazilian-cherry tree populations. In this work, a total of 17 genes were identified in E. uniflora’s transcriptome, two of which had partial DOF domains and were excluded from further analysis. Upon construction of the amino acid and nucleotide phylogenetic trees DOF sequences were grouped in 11 distinct functional groups allowing a functional prediction of 10 of the 17 E. uniflora’s genes. Conserved motifs analysis results corroborate with the evolutionary analysis made, while the selective pressure analysis confirms a purifying selective pressure. In conclusion, this study allowed the identification of novel DOF genes in the E. uniflora species. The evolutionary studies performed here paved a way for future functional studies through the prediction of conserved functional groups and elucidating previous unanswered questions.