Browsing Cellular and Molecular Biology by Author "Verli, Hugo"
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Acesso à flexibilidade molecular de ligantes como estratégia de prospecção de interações fármaco-receptor
Polêto, Marcelo Depólo (2019) [Thesis]O desenvolvimento de novos fármacos é um processo de múltiplas etapas e dispendioso em termos de custo e tempo. Nesse contexto, métodos computacionais são frequentemente empregados para interpretar e guiar ensaios experimentais ... -
Análise da estrutura e conformação de ácidos siálicos
Godoy, Brisa Raíssa Bartellt (2021) [Dissertation]Descobertos nos Deuterostômios, os ácidos siálicos (Sias) constituem uma família de carboidra- tos estruturalmente diversa, podendo ser encontrados frequentemente ligados por meio de seu carbono anomérico (C2) na configuração ... -
Análise das características estruturais de derivados de indolocarbazolas envolvidas na complexação a receptores alvo
Fontana, Crisciele (2022) [Thesis]Indolocarbazoles (ICZs) are glycosylated natural products presenting wide chemical di- versity and a broad spectrum of biological activity, notably antitumor, antimicrobial and antiviral. Through different synthetic ... -
Análise estrutural e conformacional de carboidratos depositados no Protein Data Bank
Nepomuceno, Felipe Castro (2019) [Dissertation]Os carboidratos são bem conhecidos por suas características físico-químicas, biológicas, funcionais e terapêuticas. Infelizmente, sua natureza química impõe sérios desafios para a elucidação estrutural desses fenômenos, ... -
Análise molecular do gene PAH em pacientes com fenilcetonúria e uma abordagem estrutural da enzima fenilalanina hidroxilase
Ceolato, Juliana Casagrande (2011) [Dissertation]A fenilcetonúria (PKU) é o erro inato do metabolismo dos aminoácidos mais comum e caracteriza-se por elevadas concentrações de L-fenilalanina no sangue devido a deficiência da enzima fenilalanina hidroxilase (PAH). A PAH ... -
Bases estruturais e dinâmicas de biomoléculas na via de N-glicosilação em bactérias
Arantes, Pablo Ricardo (2018) [Thesis]A N-glicosilação é uma modificação co- ou pós-traducional distribuída de forma abundante nos domínios da vida, e é caracterizada pelo reconhecimento de uma assinatura N-X-S/T nas proteínas-alvo. Os dois últimos passos para ... -
Bioinformática estrutural aplicada ao estudo de peptídeos de interesse farmacológico e biotecnológico
Villavicencio, Bianca (2020) [Thesis]O estudo de sistemas moleculares através de metodologias computacionais tem ganhado destaque no meio científico. Em particular, a busca do entendimento da estrutura e dinâmica de peptídeos mostra-se promissor, pois, apesar ... -
Biologia estrutural de ureases : filogenia, ativação e peptídeos derivados
Braun, Rodrigo Ligabue (2014) [Thesis]Ureases são enzimas níquel-dependentes que catalisam a hidrólise da ureia em amônia e dióxido de carbono. Além disso, apresentam diversas propriedades independentes da catálise, sendo consideradas proteínas moonlighting. ... -
Caracterização conformacional de carboidratos e glicoproteinas : efeitos da glicosilação na glicoproteína α1-ácida humana
Fernandes, Claudia Lemelle (2011) [Thesis]O conhecimento da glicobiologia estrutural se mantém como a parte menos explorada do estudo de estrutras tridimensionais. Considerando que a glicosilação pode estar envolvida em processos biológicos como crescimento celular ... -
Caracterização conformacional de glicoconjugados inseridos em membrana
Chiodi, Carla Gottschald (2013) [Dissertation]A glicosilação é a modificação de proteínas mais abundante que existe, ocorrendo em todos os reinos da vida e com diversos tipos de ligação proteínacarboidrato já descritos. A ligação de um carboidrato em uma sequência de ... -
Caracterização da dinâmica da complexação do receptor tipo Toll 4 humano a MD-2
Aguiar, Carla Carvalho de (2013) [Dissertation]Os receptores tipo Toll desempenham um importante papel na resposta imune inata, reconhecendo tanto padrões moleculares associados a patógenos (PAMPs), quanto padrões moleculares associados a danos (DAMPs), liberados sob ... -
Caracterização da dinâmica de modulação da trombina por inibidores covalentes e alostéricos
Giesel, Guilherme Menegon (2013) [Dissertation]A trombina é uma serino protease da família das quimotripsinas envolvida na digestão e processos degradativos que possui um importante papel na ativação dos fatores da coagulação e nas vias fibrinolíticas apresentando-se, ... -
Caracterização da maquinaria SUF responsável pela formação e associação dos cofatores [Fe-S] em Enterococcus faecalis
Riboldi, Gustavo Pelicioli (2011) [Thesis]Cofatores ferro-enxofre são grupos prostéticos inorgânicos ubíquos e evolutivamente ancestrais, cuja formação é dependente de complexas maquinarias protéicas. Três sistemas de formação distintos já foram determinados, ... -
Caracterização do reconhecimento molecular de polissacarídeos de ouriço-do-mar pela antitrombina
Becker, Camila Franco (2007) [Dissertation]A antitrombina (AT) é uma serpina glicoprotéica responsável pela inibição fisiológica das proteases da cascata de coagulação. É o receptor-alvo responsável pela ação anticoagulante da heparina e de outros glicosaminoglicanos ... -
Caracterização estrutural e conformacional de prostaglandina endoperóxido sintases
Sachett, Liana Guimarães (2011) [Dissertation]Prostaglandina Endoperóxido Sintases (PGHSs) são enzimas homodiméricas integrais de membrana, N-glicosiladas, localizadas no lúmen do retículo endoplasmático, onde catalisam o primeiro passo na síntese de prostanóides, ... -
Caracterização estrutural e conformacional de toxinas da família das actionoporinas
Vargas Filho, Edson Fauth (2010) [Dissertation]Proteínas citolíticas são produzidas por uma grande diversidade de organismos, dentre os quais destacam-se os cnidários. Estes organismos podem produzir uma série de toxinas que auxiliam na sua sobrevivência, liberadas por ... -
Comparação de diferentes campos de força na descrição conformacional de siRNAs
Arantes, Pablo Ricardo (2014) [Dissertation]siRNAs são pequenos RNAs de interferência de cadeia dupla que podem silenciar a expressão de genes específicos pós-transcricionalmente. A despeito de suas importantes funções biológicas, poucos estudos vêm se dedicando a ... -
Comportamento conformacional da urease de Canavalia Ensiformis
Braun, Rodrigo Ligabue (2010) [Dissertation]Ureases, apesar de sua importância histórica para a Bioquímica, ainda são enigmáticas. Pouco se sabe a respeito de suas propriedades não-catalíticas, por exemplo. Nesse contexto, o presente trabalho submeteu uma urease de ... -
Descrição conformacional de carboidratos e glicoproteínas : validação de protocolo baseado em dinâmica molecular e implicações funcionais
Fachin, Laércio Pol (2009) [Dissertation]O desenvolvimento de técnicas complementares a métodos experimentais clássicos, tais como a cristalografia de raios-X e a ressonância magnética nuclear (RMN), capazes de descrever e prever a diversidade estrutural e ... -
Desenvolvimento de parâmetros para simulação de flavonoides e chalconas no campo de força GROMOS
John, Elisa Beatriz de Oliveira (2017) [Dissertation]Chalconas e flavonoides são compostos comumente presentes em plantas, e constituem uma grande família de produtos naturais com um amplo espectro de atividades farmacológicas. Mudanças na estrutura destas moléculas tem se ...